Истраживачи
Šumonja, Neven
Тип
Година
Резултати 1-20 од 23
| Година | Наслов | Аутор(и) | Тип резултата | Мп-кат. |
|---|---|---|---|---|
| 2020 | Tally-2.0: upgraded validator of tandem repeat detection in protein sequences | Perović, Vladimir R.   ; Leclercq, Jeremy Y; Šumonja, Neven ; Richard, Francois D; Veljković, Nevena V. ; Kajava, Andrey V. | Научни чланак | 21a+M21a+ - Водећи међународни часопис категорије M21a+ |
| 2019 | Automated feature engineering improves prediction of protein–protein interactions | Šumonja, Neven ; Gemović, Branislava S. ; Veljković, Nevena V. ; Perović, Vladimir R. | Научни чланак | 22M22 - Међународни часопис категорије M22 |
| 2019 | The CAFA challenge reports improved protein function prediction and new functional annotations for hundreds of genes through experimental screens | Zhou, Naihui; Jiang, Yuxiang; Bergquist, Timothy R; Lee, Alexandra J; Kacsoh, Balint Z; Crocker, Alex W; Lewis, Kimberley A; Georghiou, George; Nguyen, Huy N; Hamid, Md Nafiz;
Davis, Larry; Dogan, Tunca; Atalay, Volkan; Rifaioglu, Ahmet S; Dalkıran, Alperen; Cetin Atalay, Rengul; Zhang, Chengxin; Hurto, Rebecca L; Freddolino, Peter L; Zhang, Yang; Bhat, Prajwal; Supek, Fran; Fernández, José M; Gemović, Branislava S.
; Perović, Vladimir R. ; Davidović, Radoslav S. ; Šumonja, Neven ; Veljković, Nevena V. ; Asgari, Ehsaneddin; Mofrad, Mohammad R.K.; Profiti, Giuseppe; Savojardo, Castrense; Martelli, Pier Luigi; Casadio, Rita; Boecker, Florian; Schoof, Heiko; Kahanda, Indika; Thurlby, Natalie; McHardy, Alice C; Renaux, Alexandre; Saidi, Rabie; Gough, Julian; Freitas, Alex A; Antczak, Magdalena; Fabris, Fabio; Wass, Mark N; Hou, Jie; Cheng, Jianlin; Wang, Zheng; Romero, Alfonso E; Paccanaro, Alberto; Yang, Haixuan; Goldberg, Tatyana; Zhao, Chenguang; Holm, Liisa; Törönen, Petri; Medlar, Alan J; Zosa, Elaine; Borukhov, Itamar; Novikov, Ilya; Wilkins, Angela; Lichtarge, Olivier; Chi, Po-Han; Tseng, Wei-Cheng; Linial, Michal; Rose, Peter W; Dessimoz, Christophe; Vidulin, Vedrana; Dzeroski, Saso; Sillitoe, Ian; Das, Sayoni; Lees, Jonathan Gill; Jones, David T; Wan, Cen; Cozzetto, Domenico; Fa, Rui; Torres, Mateo; Warwick Vesztrocy, Alex; Rodriguez, Jose Manuel; Tress, Michael L; Frasca, Marco; Notaro, Marco; Grossi, Giuliano; Petrini, Alessandro; Re, Matteo; Valentini, Giorgio; Mesiti, Marco; Roche, Daniel B; Reeb, Jonas; Ritchie, David W ; Aridhi, Sabeur; Alborzi, Seyed Ziaeddin; Devignes, Marie-Dominique; Koo, Da Chen Emily; Bonneau, Richard; Gligorijević, Vladimir; Barot, Meet; Fang, Hai; Toppo, Stefano; Lavezzo, Enrico; Falda, Marco; Berselli, Michele; Tosatto, Silvio C.E.; Carraro, Marco; Piovesan, Damiano; Ur Rehman, Hafeez; Mao, Qizhong; Zhang, Shanshan; Vucetic, Slobodan; Black, Gage S; Jo, Dane; Suh, Erica; Dayton, Jonathan B; Larsen, Dallas J; Omdahl, Ashton R; McGuffin, Liam J; Brackenridge, Danielle A; Babbitt, Patricia C; Yunes, Jeffrey M; Fontana, Paolo; Zhang, Feng; Zhu, Shanfeng; You, Ronghui; Zhang, Zihan; Dai, Suyang; Yao, Shuwei; Tian, Weidong; Cao, Renzhi; Chandler, Caleb; Amezola, Miguel; Johnson, Devon; Chang, Jia-Ming; Liao, Wen-Hung; Liu, Yi-Wei; Pascarelli, Stefano; Frank, Yotam; Hoehndorf, Robert; Kulmanov, Maxat; Boudellioua, Imane; Politano, Gianfranco; Di Carlo, Stefano; Benso, Alfredo; Hakala, Kai; Ginter, Filip; Mehryary, Farrokh; Kaewphan, Suwisa; Björne, Jari; Moen, Hans; Tolvanen, Martti E.E.; Salakoski, Tapio; Kihara, Daisuke; Jain, Aashish; Šmuc, Tomislav; Altenhoff, Adrian; Ben-Hur, Asa; Rost, Burkhard; Brenner, Steven E; Orengo, Christine A; Jeffery, Constance J; Bosco, Giovanni; Hogan, Deborah A; Martin, Maria J; O’Donovan, Claire; Mooney, Sean D; Greene, Casey S; Radivojac, Predrag; Friedberg, Iddo; | Научни чланак | 21a+M21a+ - Водећи међународни часопис категорије M21a+ |
| 2019 | Mapping of Protein-Protein Interactions: Web-Based Resources for Revealing Interactomes | Gemović, Branislava ; Šumonja, Neven ; Davidović, Radoslav ; Perović, Vladimir ; Veljković, Nevena | Научни чланак | 21M21 - Водећи међународни часопис категорије M21 |
| 2018 | Computational Approach to Prediction of Human Gene - Phenotype Association for Intrinsically Disordered Proteins | Vladimir Perović ; Davidović, Radoslav S. ; Branislava Gemović ; Šumonja, Neven S. ; Nevena Veljković | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2018 | Exploring the usefulness of graph properties in protein protein interaction predictions | Šumonja, Neven S. ; Veljković, Nevena V. ; Perović, Vladimir R. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2018 | Higher-order genetic interactions in prostate cancer and benign prostatic hyperplasia | Šumonja, Neven S. ; Vukovic A; Nonkovic N; Gemović, Branislava S. ; Nikolic Z ; Savić Pavićević, Dušanka Lj. ; Veljković, Nevena V. ; Brajušković, Goran R. ; Perović, Vladimir R. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2018 | Function Annotation Algorithm Based on Sequence Spectral Features: Application on Human Transcription Factors | Gemović, Branislava S. ; Davidović, Radoslav S. ; Stanković K; Šumonja, Neven S. ; Perović, Vladimir R. ; Veljković, Nevena V. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2018 | Function Annotation Algorithm Based on Sequence Spectral Features: Evaluation on Human Transcription Factors | Gemović, Branislava S. ; Davidović, Radoslav S. ; Šumonja, Neven S. ; Perović, Vladimir R. ; Veljković, Nevena V. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2018 | Biofilm-forming ability and infection potential of Pseudomonas aeruginosa strains isolated from animals and humans | Milivojević, Dušan R. ; Šumonja, Neven ; Medić, Strahinja; Pavić, Aleksandar ; Morić, Ivana ; Vasiljević, Branka ; Šenerović, Lidija ; Nikodinović-Runić, Jasmina | Научни чланак | 22M22 - Међународни часопис категорије M22 |
| 2018 | Correlation between biofilm forming ability and selected virulence characteristics in the light of infection potential of Pseudomonas aeruginosa isolated from animals and humans | Milivojević, Dušan R. ; Šumonja, Neven S. ; Morić, Ivana R. ; Ašanin, Jelena P. ; Branka Vasiljevic; Mišić, Dušan R. ; Šenerović, Lidija B. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2018 | IDPpi: Protein-Protein Interaction Analyses of Human Intrinsically Disordered Proteins | Perović, Vladimir R. ; Šumonja, Neven ; Marsh, Lindsey A.; Radovanović, Sandro ; Vukićević, Milan ; Roberts, Stefan G. E.; Veljković, Nevena V. | Научни чланак | 21aM21a - Водећи међународни часопис категорије M21a |
| 2018 | Prediction of Human Phenotype Ontology Terms For Intrinsically Disordered Proteins | Perović, Vladimir R. ; Davidović, Radoslav S. ; Gemović, Branislava S. ; Šumonja, Neven S. ; Veljković, Nevena V. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2017 | Improving a machine-learning approach for determination of genuine tandem repetitive sequences with enclosure of Fourier-based features | Perović, Vladimir R. ; Šumonja, Neven S. ; A. Kajava; Veljković, Nevena V. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2017 | Intrinsically disordered proteins protein-protein interaction prediction method based on various sequence representations | Perović, Vladimir R. ; Šumonja, Neven S. ; Radovanović, Sandro I. ; B. Gemović; Vukićević, Milan Z. ; Veljković, Nevena V. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2017 | MethSpec: a computational tool for evaluation of methylation-specific PCR primer specificity | Davidović, Radoslav S. ; Božović, Ana M. ; I. Stefanović; Kovačević, Relja Z.; Šumonja, Neven S. ; Balvanović, Roman V. ; Perović, Vladimir R. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2017 | TRI_tool: a web-tool for prediction of protein-protein interactions in human transcriptional regulation | Perović, Vladimir R. ; Šumonja, Neven ; Gemović, Branislava S. ; Toska, Eneda; Roberts, Stefan G. E.; Veljković, Nevena V. | Научни чланак | 21a+M21a+ - Водећи међународни часопис категорије M21a+ |
| 2017 | Contribution of features based on sequence, predicted PPIs and GO similarities to the prediction of gene-HPO associations | B. Gemović; Davidović, Radoslav S. ; Šumonja, Neven S. ; Veljković, Nevena V. ; Perović, Vladimir R. | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2016 | UNCOVERING HUMAN TRANSCRIPTIONAL REGULATION THROUGH THE SEQUENCE INFORMATION | Veljković, Nevena ; Perović, Vladimir ; Šumonja, Neven | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |
| 2016 | Rational design and computational profiling of I1 agonists/antagonists for GPCRs | Vučićević, Jelica ; Srdić-Rajić, Tatjana ; Nikolić, Katarina ; Glišić, Sanja ; Perović, Vladimir ; Šumonja, Neven ; Marco Pieroni; Jonne M.M. Laurila; Sabrina Tassini; Elisa Azzali;
Gabriela Costantino; Agbaba, Danica
; Mika Scheinin; Henri Xhaard; Marco Radi; Veljković, Nevena ; | Конференцијски рад | Мп категорија ће бити приказана накнадно. |